Николай Стоилков започва да третира футбол, когато е първокласник. Първата школа, в която попада, е на Вихрен (Сандански). Открива го случайно на улицата треньорът Атанас Манушев. Под ръководството на Атанас Манушев, Николай Стоилков тренира в продължение на няколко години. Футболните му умения са забелязани и така той се оказва и сред младите надежди в школата на Христо Стоичков в Етрополе. Първият договор, който подписва Николай Стоилков, е с отбора на „Чавдар“ (Етрополе), където играе в продължение на три години.
Младият защитник се връща във Вихрен, след като етрополският тим се разпада. След като играе в Чехия Николай Стоилков се завръща в България и заиграва в отбора на Септември (Симитли). Там остава година и половина преди да продължи футболната си кариера в „Банско“. След това въпреки офертите от различни отбори, той избира да дойде в Пазарджик.
Кристиано Роналдо и Лео Меси са големите футболисти, на които Стоилков е фен. Любимият му отбор пък е испанският гранд Барселона. В свободното си време освен мачове, 27-годишният футболист обича да гледа тенис. Приоритет за него обаче е висшето му образование. В момента Стоилков е трета година студент в НСА и се надява един ден да стане треньор. Докато това се случи Николай Стоилков ще продължи да играе футбол. Мечтае си един ден да попадне в голям клуб. Пожелава си да е здрав и да постигат успехи с отбора на Хебър.
